286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0011 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  100 
 
 
328 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  64.49 
 
 
313 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  49.36 
 
 
310 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  48.74 
 
 
310 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
306 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
306 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  47.66 
 
 
306 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  45.89 
 
 
310 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  45 
 
 
314 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  45.31 
 
 
314 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  44.06 
 
 
316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  44.06 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  43.75 
 
 
316 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 
310 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 
310 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 
310 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
310 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  40.92 
 
 
350 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  43.04 
 
 
310 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.99 
 
 
309 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  42.54 
 
 
310 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  42.86 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  42.86 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  42.86 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  42.86 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  42.54 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  42.54 
 
 
310 aa  245  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  42.54 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  42.28 
 
 
309 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  41.59 
 
 
310 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  38.9 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
371 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
371 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
371 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
371 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  40.63 
 
 
359 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  40.63 
 
 
359 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  38.87 
 
 
355 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  38.62 
 
 
350 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  38.87 
 
 
355 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  38.87 
 
 
355 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  38.87 
 
 
355 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  38.75 
 
 
356 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  39.03 
 
 
356 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  38.62 
 
 
355 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  41.49 
 
 
339 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 
348 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  40.48 
 
 
349 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  39.33 
 
 
359 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  42.39 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  40.66 
 
 
339 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
332 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  38.72 
 
 
319 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  37.13 
 
 
332 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  37.27 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  35.93 
 
 
323 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  37.34 
 
 
323 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
331 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  34.91 
 
 
331 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  35.44 
 
 
329 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.98 
 
 
328 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  36.11 
 
 
317 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  37.66 
 
 
309 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.94 
 
 
334 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  36.81 
 
 
323 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  35.06 
 
 
354 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  34.76 
 
 
354 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.76 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  32.45 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.8 
 
 
290 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  37.1 
 
 
345 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  32.65 
 
 
329 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  35.78 
 
 
315 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  36.12 
 
 
344 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  32.83 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  32.83 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.64 
 
 
329 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  34.16 
 
 
309 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  35.14 
 
 
334 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  34.53 
 
 
355 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  36.1 
 
 
318 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 
329 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  32.32 
 
 
365 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  34.2 
 
 
312 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  31.64 
 
 
329 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
312 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 
311 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.23 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  34.92 
 
 
288 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  31.56 
 
 
329 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  32.45 
 
 
329 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  32.1 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  33.33 
 
 
549 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>