286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0870 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  99.68 
 
 
310 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
310 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
310 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  100 
 
 
310 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  99.68 
 
 
310 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  85.48 
 
 
310 aa  547  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  85.16 
 
 
310 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  85.16 
 
 
310 aa  544  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  85.16 
 
 
310 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  85.16 
 
 
310 aa  544  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  85.16 
 
 
310 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  85.16 
 
 
310 aa  544  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  85.16 
 
 
310 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  85.16 
 
 
310 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  79.41 
 
 
310 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.73 
 
 
316 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  69.06 
 
 
316 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.73 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  66.78 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  63.78 
 
 
314 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  64.5 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  64.5 
 
 
309 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  61.86 
 
 
314 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  51.41 
 
 
339 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  53.5 
 
 
339 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  51.72 
 
 
349 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  51.72 
 
 
348 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  51.26 
 
 
353 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  45.95 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  50 
 
 
310 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  45.45 
 
 
350 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  45.15 
 
 
350 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  44.81 
 
 
359 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
371 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
371 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
371 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
371 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  45.43 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  47.85 
 
 
307 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  46.48 
 
 
355 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  45.73 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  45.43 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  46.18 
 
 
355 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  46.18 
 
 
355 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  46.18 
 
 
355 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  45.73 
 
 
359 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  46.88 
 
 
332 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  45.26 
 
 
355 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  42.86 
 
 
328 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  45.07 
 
 
310 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  42.86 
 
 
309 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  44.62 
 
 
326 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  46.05 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  46.05 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  46.05 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  42.95 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  45.72 
 
 
306 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  44.2 
 
 
329 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  42.09 
 
 
332 aa  228  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  40.91 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  42.52 
 
 
313 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  40.46 
 
 
323 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  41.46 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  39.75 
 
 
331 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  39.24 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  40.3 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  39.06 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  40.69 
 
 
330 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.05 
 
 
323 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.34 
 
 
329 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.97 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.08 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.58 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  39.62 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.8 
 
 
329 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  35.8 
 
 
329 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.35 
 
 
320 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  38.05 
 
 
309 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.35 
 
 
320 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.69 
 
 
365 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.76 
 
 
329 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  35.19 
 
 
329 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  37.54 
 
 
325 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.33 
 
 
343 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  39.03 
 
 
315 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.16 
 
 
389 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  36.2 
 
 
329 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 
310 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  36.13 
 
 
307 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.93 
 
 
324 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.01 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.18 
 
 
317 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  35.69 
 
 
325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  36.13 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  39.22 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  36.99 
 
 
323 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  36.99 
 
 
323 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.06 
 
 
335 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  36.83 
 
 
323 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>