286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7658 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  61.82 
 
 
331 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  59.39 
 
 
331 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  56.78 
 
 
326 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  51.99 
 
 
330 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  49.27 
 
 
334 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  50.31 
 
 
323 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  48.8 
 
 
329 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  47.1 
 
 
323 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  45.65 
 
 
349 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  45.65 
 
 
348 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  43.95 
 
 
353 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  47.32 
 
 
310 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  45.43 
 
 
356 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  45.26 
 
 
355 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  45.26 
 
 
355 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  45.26 
 
 
355 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  44.82 
 
 
356 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  44.14 
 
 
355 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  42.61 
 
 
350 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  43.71 
 
 
350 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  41.43 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  45.24 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  45.24 
 
 
339 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  42.18 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  42.18 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  42.18 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  42.18 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  44.34 
 
 
355 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  42.99 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  42.72 
 
 
316 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  42.99 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  42.99 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  42.72 
 
 
316 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  43.67 
 
 
310 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  43.35 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  43.35 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  43.35 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  43.35 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  43.35 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  42.72 
 
 
309 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  42.41 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  43.35 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  42.72 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  43.35 
 
 
310 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  43.04 
 
 
310 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  43.9 
 
 
359 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  41.43 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  42.24 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  41.46 
 
 
310 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  42.28 
 
 
332 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  42.09 
 
 
310 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  42.09 
 
 
310 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  42.09 
 
 
310 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  42.09 
 
 
310 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  41.77 
 
 
310 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 
319 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.96 
 
 
307 aa  209  5e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  38.72 
 
 
329 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  37.99 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.6 
 
 
343 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  40.79 
 
 
310 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  37.13 
 
 
328 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  39.46 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  41.39 
 
 
315 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  39.44 
 
 
309 aa  198  9e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.9 
 
 
329 aa  195  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 
334 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  37.1 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  36.89 
 
 
329 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.96 
 
 
320 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.34 
 
 
329 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.96 
 
 
320 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.34 
 
 
365 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.96 
 
 
329 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.66 
 
 
329 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  38.44 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.03 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.75 
 
 
323 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.62 
 
 
329 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  37.65 
 
 
325 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  39.33 
 
 
325 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 
306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 
306 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 
306 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 
306 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.58 
 
 
389 aa  182  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
355 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  37.54 
 
 
324 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  36.89 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  35.76 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.58 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  37.04 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  36.75 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  36.67 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  37.3 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.67 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>