286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0373 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  100 
 
 
317 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  41.74 
 
 
329 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  41.49 
 
 
329 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  42.15 
 
 
329 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  40.62 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  40.94 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  40.31 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  40.25 
 
 
329 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  41.88 
 
 
320 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  41.88 
 
 
320 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  45.17 
 
 
323 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  41.08 
 
 
329 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  40.51 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  45.6 
 
 
330 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  41.81 
 
 
328 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  39.94 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.18 
 
 
334 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  40.88 
 
 
318 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  39.81 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  38.91 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  42.28 
 
 
309 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40 
 
 
309 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  31.95 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  31.95 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  35.26 
 
 
306 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.5 
 
 
350 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.35 
 
 
310 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  36.33 
 
 
307 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 
349 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.01 
 
 
348 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.5 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  39.81 
 
 
309 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  33.87 
 
 
334 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
339 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  38.03 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.98 
 
 
316 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.98 
 
 
316 aa  189  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.77 
 
 
310 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  36.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  36.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.59 
 
 
343 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  36.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  38.28 
 
 
355 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
312 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.91 
 
 
350 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 
316 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  36.45 
 
 
310 aa  185  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  36.45 
 
 
310 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  39.67 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  37.57 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  37.57 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  37.57 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  38.3 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  38.18 
 
 
310 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  39.06 
 
 
312 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  41.85 
 
 
353 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  38.18 
 
 
310 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  38.18 
 
 
310 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  38.18 
 
 
310 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  38.18 
 
 
310 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  36.13 
 
 
310 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  39.68 
 
 
359 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  41.56 
 
 
345 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.65 
 
 
323 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.57 
 
 
359 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  36.77 
 
 
310 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.42 
 
 
353 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.91 
 
 
371 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.95 
 
 
359 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.95 
 
 
359 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.91 
 
 
371 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.91 
 
 
371 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  37.78 
 
 
314 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.91 
 
 
371 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  39.48 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  38.72 
 
 
310 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0989  allophanate hydrolase subunit 2  36.48 
 
 
337 aa  178  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00574869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  37.66 
 
 
325 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  36.78 
 
 
325 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  40.88 
 
 
329 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  40 
 
 
323 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  36.63 
 
 
319 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  38.89 
 
 
311 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  39.2 
 
 
339 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 
353 aa  176  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40 
 
 
323 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  39.68 
 
 
323 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 
314 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  36.62 
 
 
325 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  33.54 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  39.03 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  36.02 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  33.54 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  33.23 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>