286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01990 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  100 
 
 
365 aa  746    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  63.28 
 
 
389 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  41.9 
 
 
328 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  40.94 
 
 
343 aa  242  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.81 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
334 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.45 
 
 
329 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  37.65 
 
 
336 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  37.65 
 
 
336 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  36.47 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  37.12 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.45 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  36.78 
 
 
329 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  36.45 
 
 
329 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  36.78 
 
 
329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  43.99 
 
 
344 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  36.5 
 
 
329 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  36.65 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  36.65 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  42.95 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  40.07 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  36.13 
 
 
334 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 
329 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.62 
 
 
310 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 
310 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 
310 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  37.62 
 
 
310 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 
310 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  37.62 
 
 
310 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  37.62 
 
 
310 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 
310 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  37.3 
 
 
310 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.13 
 
 
349 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  41.98 
 
 
329 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.77 
 
 
348 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.46 
 
 
309 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
353 aa  203  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.98 
 
 
353 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  38.73 
 
 
310 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.2 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.91 
 
 
309 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  34.17 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  34.17 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  34.17 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  36.96 
 
 
339 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  41.93 
 
 
339 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.14 
 
 
316 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.69 
 
 
310 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.69 
 
 
310 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.14 
 
 
316 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.69 
 
 
310 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.69 
 
 
310 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  38.39 
 
 
310 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  36.34 
 
 
332 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  38.23 
 
 
354 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.37 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.76 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  39.94 
 
 
353 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  34.38 
 
 
310 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
371 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
371 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.82 
 
 
314 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  33.83 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.13 
 
 
350 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
371 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
359 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  33.83 
 
 
371 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 
314 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  34.43 
 
 
350 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.94 
 
 
335 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34.43 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  37.61 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  38.08 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  36.89 
 
 
325 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  38.56 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  35.03 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  34.94 
 
 
359 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  37.46 
 
 
334 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  37.42 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  42.23 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  38.23 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  35.22 
 
 
332 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  36.81 
 
 
331 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  36.39 
 
 
336 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.65 
 
 
325 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  38.73 
 
 
326 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  35.03 
 
 
319 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  36.59 
 
 
335 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  35.6 
 
 
306 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.218228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>