286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1227 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  100 
 
 
314 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  94.59 
 
 
314 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  72.44 
 
 
309 aa  461  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  70.19 
 
 
309 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  69.23 
 
 
316 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  69.45 
 
 
316 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  67.73 
 
 
310 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  68.91 
 
 
316 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  62.94 
 
 
310 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  62.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  62.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  62.94 
 
 
310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  62.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  62.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  62.62 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  62.62 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  62.94 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  61.98 
 
 
310 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  61.86 
 
 
310 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  61.86 
 
 
310 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  61.86 
 
 
310 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  61.86 
 
 
310 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  61.86 
 
 
310 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  48.75 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
348 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 
349 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  45.37 
 
 
350 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  47.84 
 
 
339 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  47 
 
 
339 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  48.86 
 
 
310 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  46.25 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  45.95 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  45.05 
 
 
359 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  44.78 
 
 
350 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  45.05 
 
 
371 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  44.78 
 
 
350 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  46.69 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  46.69 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  46.69 
 
 
355 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  45.78 
 
 
355 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  45.31 
 
 
328 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  46.28 
 
 
310 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  45.65 
 
 
359 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  45.18 
 
 
355 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  46.15 
 
 
332 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  41.18 
 
 
307 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  45.28 
 
 
306 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  45.28 
 
 
306 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  45.28 
 
 
306 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  44.34 
 
 
326 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  39.63 
 
 
319 aa  235  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  44.14 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  44.95 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  42.68 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  42.24 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  41.42 
 
 
323 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 
331 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  42.38 
 
 
309 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 
331 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  42.81 
 
 
313 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  42.64 
 
 
334 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  42.43 
 
 
330 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  42.63 
 
 
323 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.12 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
329 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  40.44 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  41.51 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  38.87 
 
 
324 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.28 
 
 
334 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  39.18 
 
 
324 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  40.79 
 
 
339 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  37.73 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  40.43 
 
 
323 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  40.4 
 
 
315 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.39 
 
 
329 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  38.56 
 
 
323 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  36.02 
 
 
389 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.82 
 
 
365 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.11 
 
 
329 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  40.25 
 
 
323 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  37.41 
 
 
311 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.11 
 
 
329 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  38.57 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  39.61 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  39.88 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  43.49 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38.17 
 
 
325 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  35.42 
 
 
325 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.48 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.08 
 
 
329 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.23 
 
 
320 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.23 
 
 
320 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  38.33 
 
 
286 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.17 
 
 
329 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 
323 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>