286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0063 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 
339 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  81.12 
 
 
339 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  64.43 
 
 
353 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  62.9 
 
 
349 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  62.9 
 
 
348 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  52.01 
 
 
371 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  52.01 
 
 
371 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  52.01 
 
 
371 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  52.01 
 
 
371 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  53.1 
 
 
355 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  52.21 
 
 
359 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  52.99 
 
 
359 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  52.99 
 
 
359 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  51.03 
 
 
350 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  51.61 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  53.29 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  51.71 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  52.37 
 
 
355 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  52.69 
 
 
356 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  52.37 
 
 
355 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  52.37 
 
 
355 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  51.61 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  53.59 
 
 
359 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  53.5 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  53.5 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  53.5 
 
 
310 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  53.5 
 
 
310 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  53.5 
 
 
310 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  53.59 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  52.02 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  52.02 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  52.02 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  52.02 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  52.02 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  51.85 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  51.54 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  51.54 
 
 
310 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  51.54 
 
 
310 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  50.31 
 
 
309 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  52.1 
 
 
332 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  48.15 
 
 
314 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  48.46 
 
 
310 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  47.84 
 
 
314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  47.48 
 
 
316 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  47.48 
 
 
316 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  47.17 
 
 
316 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  54.04 
 
 
329 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  47.48 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6365  urea amidolyase related protein  51.38 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  47.8 
 
 
326 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05395  hypothetical protein  51.56 
 
 
330 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  45.24 
 
 
332 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  46.56 
 
 
323 aa  251  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  45.45 
 
 
310 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2919  urea amidolyase-related protein  50 
 
 
323 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0103762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  46.2 
 
 
318 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  45.48 
 
 
331 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  42.59 
 
 
307 aa  232  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6366  urea amidolyase related protein  43.79 
 
 
331 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  42.99 
 
 
309 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  41.4 
 
 
319 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0011  UreA amidolyase related protein  40.66 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000028869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  43.67 
 
 
315 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  38.22 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  41.07 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  41.82 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  35.09 
 
 
343 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  41.51 
 
 
306 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  40.73 
 
 
354 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  40.73 
 
 
354 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.08 
 
 
329 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.48 
 
 
334 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  40.18 
 
 
323 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  39.02 
 
 
324 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.96 
 
 
365 aa  202  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  37.82 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  42.16 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  38.46 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  40.43 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0009  urea amidolyase related protein  40.69 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000132728 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  36.89 
 
 
323 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  38.1 
 
 
309 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  33.54 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  33.95 
 
 
321 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  33.95 
 
 
321 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  45.05 
 
 
293 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.71 
 
 
329 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  40.67 
 
 
339 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.23 
 
 
329 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  43.23 
 
 
312 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  37.08 
 
 
325 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  36.97 
 
 
325 aa  185  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  36.09 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  42.37 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  35.14 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.03 
 
 
329 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  38.29 
 
 
1207 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.54 
 
 
329 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>