286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2381 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 325 aa  648    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  80.92 
 
 		 335 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  70.53 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  67.08 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  67.39 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  67.18 
 
 		 325 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  66.67 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  65.53 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  65.11 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  65.42 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  64.8 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  64.17 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  63.55 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  61.23 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  62.93 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  62.93 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  62.93 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  62.62 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  62.62 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  64.8 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  62.62 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  62.62 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  58.77 
 
 		 325 aa  362  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  61.18 
 
 		 338 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  55.08 
 
 		 323 aa  348  9e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  56.74 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  47.98 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  43.33 
 
 		 1204 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  41.8 
 
 		 1208 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  41.61 
 
 		 1204 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.68 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  41.12 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  40.99 
 
 		 1204 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40.87 
 
 		 1212 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  43.97 
 
 		 1231 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.22 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  41.43 
 
 		 1207 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  40.37 
 
 		 1204 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  36.05 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  36.05 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  36.34 
 
 		 1822 aa  201  9e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.59 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.85 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  40.98 
 
 		 1201 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  41.61 
 
 		 1209 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.59 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.91 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.96 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  43.32 
 
 		 1197 aa  198  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.69 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  42.09 
 
 		 1200 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  43.71 
 
 		 1200 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  42.12 
 
 		 1488 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.65 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  42.9 
 
 		 1201 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  38.99 
 
 		 1209 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.71 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  40.37 
 
 		 1203 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  41.29 
 
 		 1226 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  38.3 
 
 		 1209 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  37.7 
 
 		 1206 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.88 
 
 		 365 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  41.45 
 
 		 1203 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  40.13 
 
 		 1208 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.04 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  39.88 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  39.88 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  38.96 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.63 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  41.1 
 
 		 1210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.22 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.62 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.62 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.62 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  40.62 
 
 		 1228 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  41.99 
 
 		 1233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  35.78 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  39.48 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  30.94 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  42.05 
 
 		 1238 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  39.62 
 
 		 1205 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  38.7 
 
 		 1203 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  36.88 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  40.33 
 
 		 1205 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  40.06 
 
 		 677 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  34.27 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  39.4 
 
 		 1182 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  40 
 
 		 1205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  40 
 
 		 1205 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  35.83 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.83 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  35.87 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  35.87 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.83 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  35.83 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.83 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  38.91 
 
 		 1205 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  36.51 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  30.55 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  30.55 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>