286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4581 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  100 
 
 
338 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  64.62 
 
 
325 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  66.36 
 
 
331 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  66.36 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  63.01 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.29 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  67.29 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  67.55 
 
 
325 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  67.29 
 
 
334 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  66.04 
 
 
331 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.29 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.29 
 
 
334 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  67.29 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  67.29 
 
 
334 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  62.7 
 
 
325 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  63.09 
 
 
323 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  63.41 
 
 
323 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  64.04 
 
 
323 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  61.51 
 
 
324 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  63.41 
 
 
323 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  59.94 
 
 
323 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  60.62 
 
 
325 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  61.51 
 
 
324 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  61.18 
 
 
325 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  61.8 
 
 
323 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  58.64 
 
 
335 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  47.68 
 
 
325 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  42.99 
 
 
1208 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  36.68 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40.12 
 
 
1212 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  40.37 
 
 
309 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  35.74 
 
 
329 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  35.74 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  38.64 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  35.74 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.74 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.74 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  38.96 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  36.56 
 
 
329 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  40.5 
 
 
310 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.62 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.69 
 
 
349 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.69 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 
355 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.91 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  37.42 
 
 
1822 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.63 
 
 
329 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.29 
 
 
329 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.1 
 
 
350 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  35.33 
 
 
329 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.2 
 
 
323 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  38.25 
 
 
330 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
371 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  37.97 
 
 
359 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
359 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
371 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
371 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.97 
 
 
371 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  36.49 
 
 
355 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
355 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  36.49 
 
 
355 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  37.54 
 
 
356 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  38.67 
 
 
326 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  37.27 
 
 
314 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36.96 
 
 
356 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  39.25 
 
 
1203 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  41.29 
 
 
1231 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.65 
 
 
1210 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.36 
 
 
328 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  37.77 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.81 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  37.43 
 
 
1204 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.77 
 
 
316 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  39.2 
 
 
355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.96 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  40.45 
 
 
1228 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  35.76 
 
 
350 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  37.54 
 
 
310 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  38.15 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.35 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  37.58 
 
 
314 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  36.7 
 
 
318 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  37.42 
 
 
339 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  39.3 
 
 
1197 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  38.75 
 
 
1204 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  37.65 
 
 
1204 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  37.23 
 
 
310 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  40.31 
 
 
1233 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  38.63 
 
 
359 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  37.85 
 
 
315 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  37.16 
 
 
1201 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  40.26 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.96 
 
 
309 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  38.29 
 
 
1209 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  33.02 
 
 
343 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
331 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  36.92 
 
 
310 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  39.94 
 
 
1203 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>