286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6284 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  100 
 
 
331 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  93.96 
 
 
331 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  93.05 
 
 
331 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  80.85 
 
 
334 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  80.85 
 
 
334 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  80.85 
 
 
334 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  80.85 
 
 
334 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  80.85 
 
 
334 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  80.85 
 
 
334 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  80.85 
 
 
334 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  68.87 
 
 
324 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  68.24 
 
 
323 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  67.08 
 
 
324 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  68.55 
 
 
323 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  68.01 
 
 
323 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  67.92 
 
 
323 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.2 
 
 
325 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  65.42 
 
 
325 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  62.89 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  64.17 
 
 
325 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  61.99 
 
 
335 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  66.36 
 
 
338 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  66.11 
 
 
325 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  59.82 
 
 
325 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  60.12 
 
 
323 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  57.01 
 
 
323 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  49.09 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  43.18 
 
 
1208 aa  222  8e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  43.93 
 
 
1203 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.62 
 
 
334 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  41.44 
 
 
1201 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  40.06 
 
 
1204 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  40.79 
 
 
1212 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.21 
 
 
329 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  35.5 
 
 
329 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  43.18 
 
 
1231 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  35.21 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  36.09 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  37.23 
 
 
1822 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  37.46 
 
 
323 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.69 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.99 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  38.79 
 
 
1209 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.62 
 
 
329 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.62 
 
 
329 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  36.94 
 
 
329 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.33 
 
 
320 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.33 
 
 
320 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  40 
 
 
1204 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  44.41 
 
 
1228 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  39.63 
 
 
1204 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  40.89 
 
 
1488 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  40.91 
 
 
1207 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.09 
 
 
349 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  39.81 
 
 
1209 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  40.19 
 
 
1204 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  40.71 
 
 
1226 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  41.43 
 
 
1200 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.56 
 
 
348 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  42.24 
 
 
1201 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  38.24 
 
 
1209 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  39.94 
 
 
310 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  37.46 
 
 
1206 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  40.42 
 
 
1205 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  37.39 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  38.39 
 
 
1208 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  37.1 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  41.67 
 
 
1233 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.22 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  37.1 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  37.1 
 
 
355 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 
350 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  40.52 
 
 
1203 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  34.39 
 
 
343 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.66 
 
 
328 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  36.19 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.65 
 
 
1210 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.28 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.28 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.28 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  37.17 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  37.35 
 
 
330 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  39.42 
 
 
1182 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  37.39 
 
 
355 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  36.71 
 
 
356 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.95 
 
 
350 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  36.94 
 
 
353 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  36.42 
 
 
356 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.69 
 
 
314 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  37.46 
 
 
365 aa  175  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  39.62 
 
 
1205 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  36.89 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  40.33 
 
 
1200 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  36.16 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  35.85 
 
 
310 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  35.85 
 
 
310 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4553  urea amidolyase related protein  36.34 
 
 
331 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>