286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2477 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2477  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 335 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2381  urea amidolyase related protein  80.92 
 
 		 325 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0599  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  67.92 
 
 		 325 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  67.29 
 
 		 323 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  65.84 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  66.15 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  65.53 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  64.4 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  63.24 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  63.24 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6284  allophanate hydrolase  61.99 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2955  urea amidolyase related protein  62.31 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0365  urea amidolyase related protein  61.99 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0126  allophanate hydrolase  59.5 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.254359  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1719  urea amidolyase-like protein  60.12 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0361  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  60.12 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0270  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  60.12 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2160  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  59.81 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1884  urea amidolyase-related protein  59.81 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0897  urea amidolyase-related protein  59.81 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1183  urea amidolyase-related protein  59.81 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0009  urea amidolyase related protein  62 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.871318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  58.64 
 
 		 338 aa  348  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  56.83 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3255  Urea carboxylase  53.33 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.612176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2439  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  53.42 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  48.44 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  41.77 
 
 		 1204 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  40.2 
 
 		 1208 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  40.13 
 
 		 1204 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  39.51 
 
 		 1204 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  34.18 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  35.13 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  35.65 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  35.65 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.81 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  39.17 
 
 		 1822 aa  199  7e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.18 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  39.75 
 
 		 1212 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  34.49 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  40.72 
 
 		 1201 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.18 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.49 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  40.26 
 
 		 1207 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  33.54 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  39.14 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  39.94 
 
 		 1203 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 1231 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  41.78 
 
 		 1203 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  40.06 
 
 		 1204 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  41.31 
 
 		 1488 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  41.69 
 
 		 1200 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  38.66 
 
 		 1209 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  32.72 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.24 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  40.66 
 
 		 1226 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  39.06 
 
 		 1209 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  41.04 
 
 		 1197 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.65 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  37.05 
 
 		 1206 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  38.25 
 
 		 1209 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  41.12 
 
 		 1200 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  40.72 
 
 		 1210 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  40.92 
 
 		 1201 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  38.95 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  38.7 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  36.56 
 
 		 1241 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  36.59 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  39.35 
 
 		 1233 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  36.59 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  38.51 
 
 		 1208 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  40.39 
 
 		 677 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  39.74 
 
 		 1205 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  38.79 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  34.27 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  39.22 
 
 		 1182 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  34.67 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  33.44 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.67 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.67 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  39.29 
 
 		 1205 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  39.29 
 
 		 1205 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  39.67 
 
 		 1238 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  39.29 
 
 		 1205 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  29.52 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  29.52 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  30.25 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  36.5 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  38.39 
 
 		 1228 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.33 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  36.59 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.91 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  37.95 
 
 		 1179 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  37.74 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>