More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1984 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1984  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  100 
 
 
572 aa  1157    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3279  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  53.2 
 
 
534 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.73 
 
 
497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.06 
 
 
464 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4052  hypothetical protein  27.39 
 
 
419 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 
556 aa  82  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  33.97 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  33.97 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.73 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  35.21 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  38.73 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.21 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  39.39 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  38.28 
 
 
520 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.73 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  39.23 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  39.23 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  38.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  39.23 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  39.23 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  39.23 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  39.23 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  39.23 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  39.23 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  37.5 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  37.5 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  31.69 
 
 
487 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 
674 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  37.69 
 
 
404 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  37.69 
 
 
404 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.08 
 
 
464 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  39.06 
 
 
473 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.12 
 
 
464 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.56 
 
 
479 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36.29 
 
 
489 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  35.56 
 
 
492 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  35.56 
 
 
477 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.85 
 
 
396 aa  63.9  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  30.77 
 
 
474 aa  63.9  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.1 
 
 
482 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  36.72 
 
 
503 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  36.15 
 
 
403 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.84 
 
 
502 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.15 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  34.11 
 
 
535 aa  63.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  33.82 
 
 
491 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  33.82 
 
 
479 aa  63.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.07 
 
 
481 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  32.5 
 
 
504 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  32.5 
 
 
491 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.43 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.43 
 
 
483 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  29.71 
 
 
395 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  35.51 
 
 
509 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  31.37 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  31.45 
 
 
488 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  32.81 
 
 
483 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  37.8 
 
 
511 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.21 
 
 
414 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  36.62 
 
 
528 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  34.06 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  38.24 
 
 
462 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  38.02 
 
 
483 aa  61.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.81 
 
 
477 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  29.19 
 
 
514 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  33.1 
 
 
473 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.07 
 
 
464 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 
474 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  34.81 
 
 
479 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  36.72 
 
 
474 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.92 
 
 
398 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.84 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.02 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30.83 
 
 
466 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.84 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  33.55 
 
 
383 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  34.81 
 
 
481 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.02 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  31.82 
 
 
374 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.94 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.88 
 
 
511 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  34.68 
 
 
467 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  29.73 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  32 
 
 
467 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  35.54 
 
 
495 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  35.2 
 
 
501 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.84 
 
 
502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.99 
 
 
640 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.15 
 
 
410 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  34.62 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  33.33 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.84 
 
 
485 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>