More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0467 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
497 aa  1016    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3279  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.62 
 
 
534 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000208595  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1984  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  31.6 
 
 
572 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.77 
 
 
537 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.22 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4052  hypothetical protein  26.63 
 
 
419 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.94 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  30.12 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  38.35 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.35 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  35.76 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1809  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  35.15 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  36.42 
 
 
511 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  32.65 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.39 
 
 
492 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.39 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.39 
 
 
477 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  30.33 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1154  2-alkenal reductase  38.99 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  34.75 
 
 
413 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.03 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  35.57 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  37.82 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  31.02 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  37.82 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  27.76 
 
 
511 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.64 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  34.06 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.91 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0997  FHA domain-containing protein  26.87 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.9 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.58 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  35.37 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  27 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  33.33 
 
 
492 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  31.08 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  36.05 
 
 
498 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  37.96 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.05 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  34.62 
 
 
485 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  38.46 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  37.96 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.44 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  28.28 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  34.06 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.88 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  33.13 
 
 
477 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  37.96 
 
 
524 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  36.03 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.48 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.97 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  36.17 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  35.56 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  38.89 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  34.69 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.5 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.59 
 
 
474 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  35.29 
 
 
459 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  31.54 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.51 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.23 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1430  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  37.98 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.94162  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1641  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  37.98 
 
 
518 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  30.94 
 
 
393 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1819  hypothetical protein  37.4 
 
 
518 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  32.86 
 
 
353 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  33.08 
 
 
487 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  35.29 
 
 
515 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  33.85 
 
 
485 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0449  MucD  37.98 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1664  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  37.4 
 
 
518 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.442424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  33.33 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  30.54 
 
 
467 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.32 
 
 
392 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  33.33 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.86 
 
 
424 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.48 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.71 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  33.14 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.23 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.87 
 
 
307 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  30.95 
 
 
487 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  37.12 
 
 
520 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  32.39 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  34.48 
 
 
500 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.27 
 
 
500 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  30.54 
 
 
467 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.41 
 
 
483 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  37.29 
 
 
501 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  34.62 
 
 
523 aa  64.7  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.41 
 
 
483 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.38 
 
 
394 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 
416 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>