142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4052 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4052  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.2 
 
 
464 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35 
 
 
556 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3279  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.47 
 
 
534 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000208595  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.48 
 
 
537 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 
497 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1984  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  26.42 
 
 
572 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.63 
 
 
303 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  31.21 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  30.3 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.13 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0904  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.8 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  36.19 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  36.05 
 
 
511 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0900  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
301 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.38111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.8 
 
 
492 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.54 
 
 
301 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.8 
 
 
479 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.86 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.8 
 
 
477 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  32.17 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.89 
 
 
479 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  30.71 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30 
 
 
511 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  30.71 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  26.96 
 
 
472 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  28.12 
 
 
420 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  29.75 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  42.05 
 
 
483 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  29.75 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  29.75 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.78 
 
 
516 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  33.79 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  37.76 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  29.75 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.8 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.75 
 
 
264 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  34.48 
 
 
772 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  23.86 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.18 
 
 
509 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  36.05 
 
 
528 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  29.11 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  36.26 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  29.11 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  29.11 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.78 
 
 
477 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  40.91 
 
 
474 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  29.11 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  26.92 
 
 
500 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.05 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  28.68 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  36.17 
 
 
514 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.78 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0266  trypsin domain-containing protein  31.91 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  29.03 
 
 
358 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2267  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.09 
 
 
803 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.489099  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  36.05 
 
 
479 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  36.05 
 
 
491 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  31.68 
 
 
594 aa  47  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  38.04 
 
 
501 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  28.8 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  28.91 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.9 
 
 
478 aa  46.6  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.35 
 
 
476 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  28.8 
 
 
411 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  29.29 
 
 
359 aa  46.6  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
411 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  29.71 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.21 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  39.77 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  27.91 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  23.76 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.63 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1924  endopeptidase  31.91 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  29.75 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  29.69 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  30.3 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  30.43 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  33.72 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  30.08 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  33.72 
 
 
514 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  36.73 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  39.08 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  35.58 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.64 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  28.8 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  30.43 
 
 
380 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  34.65 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  30.3 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  30.3 
 
 
362 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  37.4 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.53 
 
 
505 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  31.68 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>