More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0936 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
464 aa  936    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2395  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4052  hypothetical protein  37.2 
 
 
419 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3279  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.34 
 
 
534 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000208595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.22 
 
 
497 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1984  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  28.62 
 
 
572 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.82 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.41 
 
 
394 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  38.58 
 
 
527 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 
528 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  25.88 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  27.75 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  25.56 
 
 
516 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  28.52 
 
 
523 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  28.02 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.21 
 
 
531 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.88 
 
 
379 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  32.54 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.43 
 
 
537 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  25.77 
 
 
494 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  33.33 
 
 
344 aa  60.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  29.94 
 
 
456 aa  60.1  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  32.93 
 
 
506 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  31.01 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  26.72 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  28.37 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  28.14 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  31.01 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  31.01 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  31.01 
 
 
360 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  31.65 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  31.65 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  31.65 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  29.34 
 
 
494 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  31.65 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2267  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.89 
 
 
803 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.489099  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  33.33 
 
 
487 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  27.57 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  28.04 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  36.75 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  33.88 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  29.34 
 
 
495 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  33.88 
 
 
503 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  26.56 
 
 
518 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  29.34 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  29.34 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  29.34 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  29.34 
 
 
494 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.22 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  38 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  29.34 
 
 
494 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.59 
 
 
475 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  28.19 
 
 
502 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.13 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.09 
 
 
483 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.09 
 
 
483 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  34.88 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  35.24 
 
 
496 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  25.38 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  25.38 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  25.38 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  34.11 
 
 
360 aa  57  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.95 
 
 
484 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  25.38 
 
 
495 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  25.38 
 
 
483 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  25.38 
 
 
483 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  25.38 
 
 
483 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  35.43 
 
 
526 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  36.22 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.69 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  26.99 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.35 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  31.01 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  26.9 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  33.56 
 
 
513 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  27.7 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  36.45 
 
 
471 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  31.08 
 
 
487 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  28.17 
 
 
497 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.75 
 
 
514 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  32.21 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  26.94 
 
 
493 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  34.86 
 
 
362 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  25 
 
 
503 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  34.86 
 
 
362 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.23 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  32.06 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  27.84 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  25 
 
 
503 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  26.93 
 
 
520 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  26.69 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  34.86 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  27.27 
 
 
491 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1619  trypsin domain-containing protein  32.09 
 
 
178 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  31.61 
 
 
505 aa  54.7  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  32.35 
 
 
491 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>