More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3494 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3494  diguanylate cyclase  100 
 
 		 505 aa  1003    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246951  normal  0.101528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1305  diguanylate cyclase  55.37 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3643  diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4025  diguanylate cyclase  36.16 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000068225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4162  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 501 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0950734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  38.35 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0658  diguanylate cyclase  45.13 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  29.19 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32350  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  39.17 
 
 		 628 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.09 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532868  normal  0.92327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2011  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  29.28 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  38.32 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3042  response regulator receiver protein  26.75 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  29.71 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.06 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  31.39 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  33.33 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.74 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.55 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  28.79 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 362 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0266  diguanylate cyclase  34.69 
 
 		 942 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2856  GGDEF domain-containing protein  29.48 
 
 		 568 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4314  diguanylate cyclase  29.12 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  36.89 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  37.38 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  28.47 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1305  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 256 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.51 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  37.01 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.89 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1657  diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2276  diguanylate cyclase  34.45 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40422  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1598  diguanylate cyclase  34.45 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  35.2 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  35.2 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1161  diguanylate cyclase  40.19 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0876222  normal  0.647833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.19 
 
 		 1079 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.29 
 
 		 692 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.25 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 		 1636 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  29.5 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  31.06 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  31.82 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.13 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4046  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.170449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  29.27 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.19 
 
 		 570 aa  60.1  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 718 aa  60.5  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.59 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  30.06 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3851  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  35.83 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  27.75 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.65 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4131  diguanylate cyclase  30.57 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0034  diguanylate cyclase  31.15 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523887  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1583  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.75 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.92 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  38.84 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4158  diguanylate cyclase  34.44 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870155  normal  0.271744 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0422  diguanylate cyclase  31.34 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  33.08 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  29.36 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  32.48 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.34 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.82 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.88 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.34 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  29.12 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0104  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.851884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0058  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.19 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.218721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 		 1649 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1528  diguanylate cyclase  28.23 
 
 		 1339 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.646539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.79 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  31.19 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0697  diguanylate cyclase  38.71 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.184616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.86 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0304  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.19 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318704  normal  0.0663849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.86 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1619  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.12 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.702165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  34.82 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>