100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2320 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 345 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  36.08 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  43.24 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  38.11 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  42.41 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  41.7 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  41.7 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  41.7 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  42.15 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  36.54 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  34.96 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  37.54 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  37.54 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  37.24 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  37.24 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  37.24 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  37.13 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  37.24 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  36.95 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  36.9 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  33.86 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  33.86 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  33.9 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  37.95 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  37.95 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  34.44 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  36.76 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  41.27 
 
 		 208 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  36.81 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  33.52 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  32.46 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  27.76 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  30.58 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.7 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  35.71 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  33.33 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  24.9 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.1 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  30.86 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  30.86 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  23.41 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  30.86 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.01 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  28.26 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  30.12 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  28.26 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.45 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  28.26 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  32.93 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  28.11 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.31 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.88 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  32.43 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  29.55 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  35.34 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  26.11 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.66 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.66 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.87 
 
 		 274 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  38.57 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.77 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  29.1 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  24.55 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  30.15 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  28.67 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.93 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  28.22 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  42.5 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  23.53 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  25.84 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  27.13 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  22.27 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  27.4 
 
 		 296 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  23.81 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  28.03 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  41.54 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  26.54 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  41.54 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  26.14 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  25.84 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  25.91 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  27.78 
 
 		 281 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  26.9 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  31.11 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.51 
 
 		 234 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.49 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  26.62 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  28.47 
 
 		 233 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>