133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1402 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  100 
 
 		 301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  65.57 
 
 		 300 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  63.09 
 
 		 313 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  65.57 
 
 		 301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  65.57 
 
 		 301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  65.57 
 
 		 301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  67.88 
 
 		 299 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  67.55 
 
 		 299 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  67.55 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  67.22 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  67.22 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  67.22 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  67.22 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.33 
 
 		 292 aa  321  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  62.98 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  52.52 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  51.1 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  42.6 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  42.86 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  39.57 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  37.59 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  37.59 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  36.25 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  37.39 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  34.12 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  34.12 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  46.92 
 
 		 208 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  30.58 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  33.82 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  29.31 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  36.55 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  34.85 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  36.68 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  35.61 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  32.21 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.21 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  29.96 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  32.98 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  31.28 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  29.55 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  30.73 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  35.38 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  29.13 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  30.12 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  30.12 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.07 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  31.12 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  31.11 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.02 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  27.35 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  29.32 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  29.32 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.7 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  31.41 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.7 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.7 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  30.32 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  31.61 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  30.29 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.53 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  27.71 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  31.18 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  31.18 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  31.38 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.12 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  29.96 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.15 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  29.68 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  30.89 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  29.29 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  34.42 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  29.41 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.47 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  28.25 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.06 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  32.67 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  32.12 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  30.37 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.63 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  36.84 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  27.85 
 
 		 249 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  27.67 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  34.78 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  26.22 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  31.78 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  27.63 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.89 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  27.2 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  27.62 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  27.51 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  32.48 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  28.19 
 
 		 345 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  35.07 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  30.89 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  32.26 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  33.56 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>