160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7202 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 279 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  94.62 
 
 		 279 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  95.34 
 
 		 279 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  95.34 
 
 		 279 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  91.1 
 
 		 281 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  91.46 
 
 		 281 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  75.99 
 
 		 279 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  74.02 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  74.02 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  74.02 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  68.88 
 
 		 283 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  67.6 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  68.44 
 
 		 281 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  60.55 
 
 		 288 aa  321  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  57.34 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  58.33 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  60 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  62.72 
 
 		 283 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  57.34 
 
 		 286 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  52.43 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  53.97 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  46.3 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  41.95 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  43.78 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  41.84 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  42.98 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  38.05 
 
 		 289 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  37 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  40.61 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  42.51 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  38.36 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  42.03 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  34.71 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  35.02 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  36.96 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  39.55 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  38.5 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  35.9 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  35.04 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  37.64 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  34.89 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  37 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  38.72 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  32.62 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  34.18 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  33.62 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  32.61 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  35.98 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  32.84 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  31.2 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  32.61 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  31 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  32.23 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  33.67 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.83 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  32.64 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  33.61 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  35.98 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  33.67 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  29.67 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  31.17 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  29.06 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  37.43 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  33.33 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  32.49 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  32 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  27.38 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  31.94 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  31.25 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  32.12 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  29.24 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  31.01 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  28.63 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  28.63 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  35.23 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  32.13 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.28 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.4 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.7 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  33.16 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  28.39 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  27.95 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.67 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.25 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  29.5 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.41 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.95 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.89 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  26.41 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  31.22 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  28.26 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.26 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  30.26 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>