160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2643 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  86.12 
 
 
281 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  73.85 
 
 
283 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  67.14 
 
 
279 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  67.14 
 
 
279 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  67.84 
 
 
279 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  66.32 
 
 
279 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  70.67 
 
 
279 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  68.68 
 
 
281 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  68.68 
 
 
281 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  70.46 
 
 
281 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  70.46 
 
 
281 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  70.46 
 
 
281 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  61.51 
 
 
288 aa  322  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  57.84 
 
 
282 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  61.45 
 
 
269 aa  314  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  62.07 
 
 
283 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  55.24 
 
 
284 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  54.55 
 
 
286 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  53.02 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  51.88 
 
 
261 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  46.36 
 
 
262 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  48.61 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  47.93 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  42.04 
 
 
289 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  40.89 
 
 
272 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  42.23 
 
 
291 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  37.66 
 
 
292 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  36.82 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  38.55 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  36.82 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  35.95 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  34.69 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  40.26 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  38.12 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  36.33 
 
 
274 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  34.63 
 
 
305 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  38.53 
 
 
274 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  37.83 
 
 
307 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  37.83 
 
 
307 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  37.43 
 
 
272 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  37.93 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  33.16 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  37.15 
 
 
309 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  36.92 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  34.33 
 
 
265 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  33.9 
 
 
332 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  31.9 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  30.47 
 
 
342 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  34.72 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  34.4 
 
 
267 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  32.63 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  32.02 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  33.76 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  31.2 
 
 
345 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.23 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  33.88 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  34.11 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  36.6 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  36.6 
 
 
261 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  31.58 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  32.74 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  34.33 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  33.47 
 
 
260 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  29.95 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.33 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  30.39 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.62 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30.45 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.98 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.02 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  31.2 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.21 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  33.48 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  31.05 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.21 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  36.65 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.6 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  33.04 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  34.41 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  27.2 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.95 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.95 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  32.4 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  30.7 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.89 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.97 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  31.66 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.31 
 
 
233 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  28.51 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  31.56 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  31.56 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 
316 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  28.86 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.02 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  29.23 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>