96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0649 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 312 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  51.4 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  50.3 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  49.84 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  44.98 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  44.96 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  35.6 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  36.73 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.83 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  35.45 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  35.45 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.52 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  31.4 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  32.53 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  35.56 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  34.75 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.73 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  40.16 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  32.64 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  29.92 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.34 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  31.34 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  31.34 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  30.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  32.66 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  34.15 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.7 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  27.8 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  30.37 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  32.37 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  32.37 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  30.66 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  34.97 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  29.57 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  27.86 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  30.41 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  32.5 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  32.5 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.08 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  27.94 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  27.7 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.69 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  27.85 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  25.25 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  33.83 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  28.74 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  25.56 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  25.76 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  28.06 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  34.29 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  31.71 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  25.93 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.31 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.77 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  26.81 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  32.17 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  30 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  30 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  25.15 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  23.41 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  25.15 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  25.1 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  31.75 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  30.63 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  25.84 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  43.75 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.71 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  28.99 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  42.19 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.15 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  31.62 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  30.61 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  23.39 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  23.39 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  30.3 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  30.61 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.45 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  23.39 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  31.62 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>