174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1039 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  39.09 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  37.29 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  33.49 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  29.39 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  31.36 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  32.77 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.47 
 
 		 274 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  34.09 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  34.17 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  29.91 
 
 		 272 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  31.98 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  34.17 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.53 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  30.85 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  34.05 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  34.16 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  36.24 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  28.84 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  31 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  30.65 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  30.47 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  31.75 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  28.45 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  30.28 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  33.52 
 
 		 279 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  32.97 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  33.02 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  33.86 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  32.97 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  32.97 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  35.75 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  29.61 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  32.81 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  32.31 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  29.63 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.88 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.99 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  30.04 
 
 		 288 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  29.73 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  30.63 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  29.73 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  29.73 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  31.58 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  30.98 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  31 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  30.32 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  28.88 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.56 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  25.87 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.25 
 
 		 305 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  30.92 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  32.39 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.09 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.74 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  33.8 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  30.17 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  31.72 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  28.04 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  28.72 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  32.02 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  31.15 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  27.63 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.32 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  31.28 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  28.34 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.44 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  29.94 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.29 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.67 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1208  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.37 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000207923  decreased coverage  8.378480000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  34.78 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  29.51 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  28.16 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  42.48 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.78 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  37.74 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  31.35 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  40.71 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  29.13 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  42.48 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  29.13 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  29.13 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.46 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  28.46 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.46 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0334  Flp pilus assembly CpaB  30.91 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29.44 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>