155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2359 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 272 aa  540  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  61.96 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  56.36 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  37.55 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  35.86 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  36.02 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  40.31 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  36.26 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  35.5 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  35.04 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  35.04 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  35.04 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  38.42 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  34.89 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  38.42 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  38.42 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  38.97 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  35.5 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  36.92 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  37.89 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  38.17 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  34.96 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  37.7 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  37.7 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  35.59 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  36.18 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  34.35 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  33.58 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  32.36 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  34.42 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  33.17 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.66 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  28.94 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  35.96 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  32.77 
 
 		 342 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  31.42 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  32.34 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  33.2 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  27.52 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.79 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  32.65 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  28.79 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  28.79 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  28.79 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  28.79 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  28.79 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.32 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  28.63 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.21 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  31.79 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  31.09 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  32.98 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.29 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  27.17 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.49 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.18 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  28.81 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  32.63 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  28.46 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  30.08 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.67 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  31.3 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  24.9 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.65 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  31.08 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  28.08 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  34.52 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.22 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  32.03 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  28.98 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  30.48 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  34.03 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  31.17 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  28.17 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  27.54 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.85 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  26.64 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  27.78 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  27.92 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.07 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  29 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  32.79 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  27.8 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  34.53 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  28.79 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  28.69 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  35.71 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.31 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  32.48 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  38.39 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  25.91 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>