148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3420 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 342 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  98.25 
 
 		 342 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  82.2 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  53.45 
 
 		 345 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  52.99 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  52.38 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  52.38 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  52.38 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  52.38 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  52.38 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  38.91 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  39.77 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  34.05 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  34.92 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  34.64 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  33.99 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  33.61 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  36.29 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  38.97 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  34.59 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  36.15 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  37.06 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  34.62 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  36.07 
 
 		 261 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  38.27 
 
 		 268 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  32.77 
 
 		 272 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  32.81 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  33.85 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  34.72 
 
 		 305 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  31.31 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  34.26 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  28.44 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  32.66 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  31.47 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  35.35 
 
 		 271 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  35.62 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  37.3 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  33.04 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  32.77 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  33.04 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  33.04 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  32.73 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  35.8 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  34.9 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  34.3 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  31.28 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  32.31 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.69 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  29.48 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  30.28 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.33 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  35.14 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  31.11 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  31.11 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  31.11 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  33.97 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  32.17 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  36.5 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  30.63 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  30.4 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.46 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  28.35 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  37.18 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.82 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  35.44 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  35.44 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.13 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  32.74 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.97 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.65 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  30.08 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  30.05 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  35.67 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  31.15 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  32.89 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  33.74 
 
 		 270 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  30.47 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.2 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  30.17 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  28.28 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  30.41 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  30.35 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.24 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  30.81 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  42.48 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  31.54 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  30.83 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.17 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.41 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  27.69 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  32 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.01 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  32.73 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  32.83 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  25.14 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>