160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0648 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 281 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  86.83 
 
 		 280 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  76.22 
 
 		 283 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  70.67 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  71.02 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  71.02 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  68.44 
 
 		 279 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  71.28 
 
 		 281 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  71.28 
 
 		 281 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  69.04 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  67.62 
 
 		 281 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  67.62 
 
 		 281 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  67.62 
 
 		 281 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  64.11 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  61.09 
 
 		 288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  59.03 
 
 		 282 aa  318  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  61.59 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  56.1 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  54.55 
 
 		 286 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  55.99 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  52.06 
 
 		 261 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  49.54 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  45.45 
 
 		 262 aa  199  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  43.09 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  41.48 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  41.13 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  39.11 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  41.43 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  36.14 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  38.49 
 
 		 292 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  35.42 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  36.36 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  36.71 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  38.57 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  38.39 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  33.69 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  40.82 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  40.82 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  37.89 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  38.5 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  33.77 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  32.98 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  36.6 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  35.82 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  35.19 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  32.46 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  35.08 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  36.02 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  34.93 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  31.58 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.68 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  36.08 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  34.69 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  36.08 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  36.65 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  36.18 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.27 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  32.63 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  32.32 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.97 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  30.2 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.04 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  32 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  33.18 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.22 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.98 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  27.98 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  35.35 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30.45 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  28.87 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  34.07 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  28.92 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  31.09 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.3 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  32.58 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.63 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  34.41 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.77 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  32.4 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  32.62 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  30.58 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  33.16 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.65 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  33.87 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  31.18 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  25.71 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  29.58 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  28.78 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.5 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.28 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  28.24 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.84 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.95 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  29.41 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>