140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1884 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  99.71 
 
 		 350 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  99.14 
 
 		 350 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  99.14 
 
 		 350 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  99.71 
 
 		 350 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 350 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  99.14 
 
 		 350 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  90.21 
 
 		 345 aa  527  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  53.29 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  53.29 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  52.09 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  35.29 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  44.07 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  30.98 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  34.55 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  40.13 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  33.78 
 
 		 260 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  40.54 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  30.14 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  37.18 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.8 
 
 		 275 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  34.76 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  35.04 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  33.05 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  37.42 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  29.58 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  32.63 
 
 		 249 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  33.48 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  32.16 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  29 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  28.7 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  30.67 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  38.24 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.74 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  31.85 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  32.32 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  31.71 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.47 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  33.13 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  30.26 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  36.77 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  36.77 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  36.77 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.53 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  28.86 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  28.68 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  36.67 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  31.33 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  34.64 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.25 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  30.09 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  31.52 
 
 		 267 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  31.41 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  33.1 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  27.38 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  28.21 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  29.38 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  32.43 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.86 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  23.87 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  31.74 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  32.65 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  32.41 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  34.78 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  28.48 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  30.14 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  28.38 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.03 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  34.93 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  35.17 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  34.93 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  35.17 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  35.17 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  35.17 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  33.12 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  31.13 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  32.48 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  36.03 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  32.42 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  33.56 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  28.95 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  35.77 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  31.58 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  25.56 
 
 		 258 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  33.57 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  31.94 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  26.85 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  32.76 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  27.7 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.38 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  33.08 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  29.3 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>