133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0245 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  40.38 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  33.6 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  30.88 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.13 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  33.63 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  32.24 
 
 		 234 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.69 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  26.61 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  27.16 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  25.51 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.74 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  28.82 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  29.07 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  25.11 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.61 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  26.76 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  33.79 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  26.07 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  26.5 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.02 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  34.75 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  27.23 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  26.61 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  27.8 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  36.89 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.77 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  25.37 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  28.82 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  30.73 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.41 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  24.65 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  29.33 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  26.67 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.11 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.38 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  36.36 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.38 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  24.56 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  26.77 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.07 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  26.72 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  25.78 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  24.07 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  28.63 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.19 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  25.52 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  28.8 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.11 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  24.89 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  30.41 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  32.11 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  31.37 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  23.53 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  25.74 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  27.47 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.67 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  32.17 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  28.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  25.68 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  27.2 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  25.98 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  28.14 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  25.32 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  24.58 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  28.65 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  23.68 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  29.51 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.86 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  31.32 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  24.89 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  28.31 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  30.91 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.4 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  25.56 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  28.77 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.77 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  28.77 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1208  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.4 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000207923  decreased coverage  8.378480000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  30 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  32.76 
 
 		 342 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  28.77 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  28.77 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  28.77 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  25.42 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  25.42 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  30.09 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  25.42 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  27.64 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  32.76 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>