45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3354 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  90 
 
 		 267 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.84 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  29.96 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.93 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  25.87 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  26.85 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  27.88 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  25.49 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  25.35 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  27.07 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  25.13 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  25.13 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  25.13 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  25.48 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  25.26 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  25.93 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  23.45 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  23.45 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  23.45 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  22.22 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  24.23 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  22.99 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  23.4 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  24.06 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  24.08 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  24.1 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  21.95 
 
 		 282 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  24.89 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  25.13 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  29.41 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  26.45 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  26.45 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  26.45 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  23.53 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  21.3 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  23.92 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  27.39 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  26.67 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  24.77 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.07 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  24.34 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  27.91 
 
 		 342 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>