33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  40.83 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  38.19 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  38.19 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  45.21 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  42.27 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  40 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  42.41 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  38.46 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  38.37 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.5 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  36.99 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  42.86 
 
 		 378 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  41.04 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  36.24 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  32 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  36.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  31.68 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  37.7 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  34.94 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  42 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  29.27 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  33.08 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  27.78 
 
 		 307 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  28.16 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  41.57 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38.14 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  25.89 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 307 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.04 
 
 		 291 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  44.07 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>