33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3695 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  100 
 
 		 224 aa  397  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  45.95 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  38.81 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  45.24 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  30.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  45.11 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  43.65 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  35.12 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  38.69 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  43.75 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  35.14 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  47.42 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  47.42 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  38.79 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  31.65 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  36.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  32.09 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  31.62 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  34.62 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  29.94 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  39.76 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  32.18 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  38.38 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  41.22 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  34.92 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  29.5 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  30.43 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  35.51 
 
 		 218 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  29.37 
 
 		 267 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  30.22 
 
 		 279 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  36.36 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>