31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0157 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  454  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  42.26 
 
 
205 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  41.85 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.88 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  33.65 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  41.79 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  41.84 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  41.67 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  36.73 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  44.19 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  45.6 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  35.71 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  35.2 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  35.2 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  43.1 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  35.06 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  47 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  36.42 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  34.59 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  40.46 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  37.25 
 
 
191 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  40.4 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.64 
 
 
292 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  35 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  35.26 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13080  SAF domain-containing protein  31.65 
 
 
211 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0668426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.12 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.78 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  33.88 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0314928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>