24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1409 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  100 
 
 		 220 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  39.64 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  41.07 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  41.2 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  40.19 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  40.83 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  45.59 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  36.26 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  42.86 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  38.51 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  39.51 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  39.22 
 
 		 378 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  36.65 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  34.63 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  27.5 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  35.77 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  32.94 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  35.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  29.41 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  32.08 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>