29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0369 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  51.2 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  49.34 
 
 		 378 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  42.35 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  39.89 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  39.31 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  35.84 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  35.84 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  28.43 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  40.71 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  40.48 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  34.83 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  38.64 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  36.99 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  42.48 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  31.09 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  34.34 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  36.48 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  48 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  42.42 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  42.72 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  39.6 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  39.86 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.97 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.45 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.37 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  25.93 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38.83 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>