26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1894 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  71.43 
 
 
217 aa  268  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  63.43 
 
 
218 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  60.45 
 
 
218 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  60.45 
 
 
218 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  60.45 
 
 
218 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  46.05 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  40.19 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  40.59 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  42.68 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  41.73 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  41.14 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  33.71 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  34.81 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  42.57 
 
 
378 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  45.54 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  36.65 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  34.55 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38.69 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  37.3 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  39.06 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  36.23 
 
 
261 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13080  SAF domain-containing protein  34.52 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0668426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  37.27 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  40.35 
 
 
312 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  42.86 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>