22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4836 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  71.43 
 
 
217 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  61.4 
 
 
218 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  61.82 
 
 
218 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  61.82 
 
 
218 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  60 
 
 
218 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  38.91 
 
 
218 aa  111  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  40.74 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  41.91 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  36.53 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  38.03 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  43 
 
 
378 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  43.8 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  34.73 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  32.73 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  31.85 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  38.46 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  38.89 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  32.48 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  28.48 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  35.04 
 
 
261 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  36.5 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>