29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8655 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  56.02 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  35.1 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  49.3 
 
 		 378 aa  98.2  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  34.65 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  42.29 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.99 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  42.26 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  45.63 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  45.93 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  45.93 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  49.14 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  42.24 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  46.72 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  37.58 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  34.54 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  46.77 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  38.6 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  34.83 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  41.43 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  47.62 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  37.01 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  36.14 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  34.59 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.38 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  30.41 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.94 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  29.21 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  30.37 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>