22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0625 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  100 
 
 		 191 aa  348  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  38.89 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  47.66 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  37.96 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  35.75 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  39.81 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  39.33 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  42 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  34.65 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  34.65 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  45.74 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  35.78 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  33.1 
 
 		 272 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  35.77 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  37.96 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  30.77 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  46.27 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  36.45 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  37.3 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.73 
 
 		 292 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>