49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0786 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  51.2 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  41.32 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  41.63 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  35.65 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  45.06 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  43.38 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  37.95 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  37.95 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  39.05 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  42.03 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  36.96 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  41.41 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  41.46 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  40 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  44.35 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  40.46 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  38.93 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  40.74 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  42.45 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  27.73 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  28.18 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  45.19 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  41.38 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  41.61 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  33.91 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  34.42 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  32.14 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  36.03 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  34.85 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  34.85 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  34.85 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13080  SAF domain-containing protein  38.68 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0668426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  34.85 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  36.48 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  34.09 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  35.34 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  31.51 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  28.81 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.61 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  28.1 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  32.41 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  26.47 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3713  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.17 
 
 		 336 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  30.99 
 
 		 215 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  45.45 
 
 		 266 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29.79 
 
 		 317 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>