36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0535 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  53.55 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  40.93 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  30.66 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  32.89 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.21 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  26.03 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  28.19 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  25.71 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  24.66 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  24.55 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  24.16 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  24.32 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  24.32 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  30.13 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.37 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  24.88 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  31.31 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  22.09 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  24.66 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  27.98 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.52 
 
 		 234 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  21.57 
 
 		 390 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  26.44 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.96 
 
 		 339 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  20.78 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  25.67 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  25.41 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  29.57 
 
 		 296 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  23.66 
 
 		 274 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  26.29 
 
 		 275 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.19 
 
 		 266 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>