20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0833 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  100 
 
 
235 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  45.59 
 
 
227 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  39.52 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  36.27 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  30.41 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  31.25 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  35.07 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  30.11 
 
 
238 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0334  Flp pilus assembly CpaB  29.94 
 
 
229 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  36.44 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1672  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  31.61 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  33.01 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23910  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  40.71 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  31.03 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  36.31 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  33.94 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  31.36 
 
 
220 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.56 
 
 
316 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>