32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  40.83 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  38.97 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  30.18 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  38.36 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  45 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.6 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  37.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  37.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  28.46 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  46.05 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.91 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  36.53 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38.15 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  36.21 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13080  SAF domain-containing protein  38.18 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0668426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  29.95 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  34.21 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  31.16 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  34.06 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  36.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.88 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  33.15 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  39.42 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  34.25 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  39.58 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  33.53 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  31.4 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.15 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>