42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2867 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  67.92 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  35.67 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  38.06 
 
 		 378 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  32.96 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  36.09 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  34.43 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  32.7 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  32.7 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  27.78 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  32.4 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  31.97 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  39.58 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  32.07 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  32.58 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  28.32 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  31.85 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  25.24 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  25.24 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  29.33 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.19 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  25.24 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  26.17 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  24.88 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  36.79 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  27.06 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  30.29 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  29.94 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  33 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.25 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.25 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  29.53 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  27.82 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  27.19 
 
 		 282 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  28.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  31.73 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  24.42 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  25.44 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  25.12 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>