30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3274 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  100 
 
 		 218 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  40.22 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  41.07 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  38.91 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  39.23 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  41.41 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  37.13 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  40.14 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  41.38 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  34.13 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  39.25 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  35 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  30.43 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  45 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  41.75 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  32.99 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  40.78 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  26.23 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.15 
 
 		 272 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.75 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  29.06 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.8 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.89 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  29.36 
 
 		 260 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  29.36 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>