22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4647 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  100 
 
 		 219 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  39.78 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  41.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  35.37 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  35.37 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  47.83 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  42.41 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  43.5 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  40.85 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  37.06 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  46.85 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  42.31 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  34.93 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  39.51 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  39.62 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  41.44 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  49.37 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  44 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  43.62 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.39 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>