31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2574 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  100 
 
 
242 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  67.92 
 
 
213 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  38.38 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  36.26 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  37.96 
 
 
378 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  37.72 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  36.97 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  35.51 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  33.14 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  32.82 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  36.26 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  31.68 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  31.95 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  30 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  32.12 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  31.98 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  39.62 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  38.05 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  39.62 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  30.72 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  31.07 
 
 
207 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  26.9 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  32.56 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  34.33 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  31.5 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  34.02 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.75 
 
 
292 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  26.9 
 
 
307 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  24.72 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  26.74 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>