25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2816 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  100 
 
 
227 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  44.93 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  38.97 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  39.81 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  42.64 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  31.92 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  31.71 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.81 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.1 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  41.75 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  40.54 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  43.48 
 
 
378 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  32.76 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1672  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  30.67 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  44.44 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0334  Flp pilus assembly CpaB  27.27 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  36.72 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  34.57 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  36.94 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  33.85 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  26.37 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.21 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  36.45 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>