22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0901 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  100 
 
 
207 aa  374  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  33.96 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  39.63 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  39.9 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  41.1 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  36.52 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  31.88 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  38.64 
 
 
378 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  37.5 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  36.84 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  34.25 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  41.96 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  40.27 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  32.84 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  37.7 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  33.94 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  33.94 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  33.77 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  33.1 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  34.9 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  37.96 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.18 
 
 
287 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>