24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4293 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  94.04 
 
 		 218 aa  357  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  62.27 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  61.82 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  60.45 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  42.05 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  37.5 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  43.05 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  49.51 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  45.1 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  38.04 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.7 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  37.57 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  36.84 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  41.75 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  35.26 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  37.67 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  30.3 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  53.45 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  43.28 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  40.54 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  35.36 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  34.88 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>