24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4671 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  94.04 
 
 
218 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  94.04 
 
 
218 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  62.21 
 
 
218 aa  235  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  60 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  60.45 
 
 
217 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  42.05 
 
 
218 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  37.5 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  49.14 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  48.54 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  43.14 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  37.42 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.08 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  36.99 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  36.16 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  37.14 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  40.78 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  30.72 
 
 
242 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  36.55 
 
 
261 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  43.28 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  42.34 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  40.88 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  34.11 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  33.33 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>