42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4090 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  100 
 
 		 218 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  51.2 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  35.38 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  45.76 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  43.48 
 
 		 378 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  35.98 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  41.76 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.36 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  44.94 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  36.68 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  36.68 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  36.9 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  35.41 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  42 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  33.17 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  40.31 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  45.92 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  35.77 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  44.14 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  38.18 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  32.43 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  32.43 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  26.46 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  33.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  32 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  32 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  27.23 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0833  SAF domain protein  34.32 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.753412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.84 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  34.71 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  28.86 
 
 		 307 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  31.06 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  28.95 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  37.41 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  32.16 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  28.95 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  35.04 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.26 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0107  hypothetical protein  72.41 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897368  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  32.74 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>